Thiết bị y tế nhập khẩu qua cảng Sài Gòn khu vực 4. Ảnh: T.H

Theo các doanh nghiệp, đối với các mặt hàng thuộc nhóm này, thời gian vừa qua phát sinh vướng mắc rất nhiều về việc yêu cầu phải có xác nhận của Bộ Y tế để được áp dụng mức thuế suất 5% đối với các mặt hàng không được định danh cụ thể tại khoản 8 Điều 1 Thông tư số 26/2015/TT-BTC và không thuộc Danh mục trang thiết bị y tế được nhập khẩu theo Giấy phép của Bộ Y tế. Trong khi đó, Bộ Y tế không xác nhận trang thiết bị y tế nhập khẩu cho doanh nghiệp.

Tại buổi đối thoại, Phó Cục trưởng Cục Hải quan TPHCM Phan Minh Lê và Chi cục Hải quan quản lý hàng đầu tư đã chia sẻ và ghi nhận vướng mắc của doanh nghiệp để tiếp tục báo cáo cơ quan có thẩm quyền xem xét.

Theo Cục Hải quan TPHCM, đơn vị đang bị áp lực rất lớn do phản ứng từ cộng đồng doanh nghiệp trong việc áp dụng chính sách thuế GTGT đối với hàng hóa nhập khẩu là trang thiết bị y tế không thuộc danh mục Thông tư số 30/2015/TT-BYT, Thông tư 14/2018/TT-BYT và chưa được định danh cụ thể tại Khoản 8 Điều 1 Thông tư số 26/2015/TT-BTC ngày 27/02/2015 của Bộ Tài Chính, bổ sung sửa đổi khoản 11 Điều 10 của Thông tư số 219/2013/TT-BTC ngày 31/12/2013 của Bộ Tài Chính.

Mới đây, ngày 12/8/2019 Bộ Y tế có công văn số 4658/BYT-TB-CT gửi Văn phòng đại diện các hãng, các công ty nhập khẩu, kinh doanh trang thiết bị y tế trả lời về việc xác nhận trang thiết bị y tế để được áp dụng thuế suất GTGT 5% theo yêu cầu của cơ quan Hải quan.

Theo đó, Bộ Y tế sẽ không xác nhận trang thiết bị y tế nhập khẩu cho doanh nghiệp để cơ quan Hải quan xem xét áp thuế suất 5%. Hàng hóa được xác định là trang thiết bị y tế căn cứ qui định tại Nghị định 36/2016/NĐ-CP ngày 15/5/2016 được sửa đổi bổ sung tại Nghị định số 169/2018/NĐ-CP ngày 31/12/2018.

Ngày 31/12/2018, Chính phủ ban hành Nghị định 169/2018/NĐ-CP sửa đổi, bổ sung một số Điều của Nghị định 36/2016/NĐ-CP ngày 15/5/2016 của Chính phủ về quản lý trang thiết bị y tế.

Theo đó, tại khoản 39 Điều 1 Nghị định quy định một số trang thiết bị y tế đáp ứng một số điều kiện thì không cần không cần văn bản xác nhận là trang thiết bị y tế của Bộ Y tế khi thực hiện thủ tục thông quan.

Do đó, nhiều trường hợp doanh nghiệp xin xác nhận của Bộ Y tế được Bộ Y tế trả lời không phải xác nhận. Trong khi đó, theo quy định hiện nay của Bộ Tài chính cần có xác nhận của Bộ Y tế để được áp dụng mức thuế suất thuế GTGT 5%.

Để tháo gỡ khăn cho doanh nghiệp, Cục Hải quan TPHCM kiến nghị Bộ Tài chính phối hợp với Bộ Y tế ban hành Danh mục các mặt hàng được áp dụng mức thuế suất thuế GTGT 5% nhập khẩu cụ thể theo mã HS. Theo đó, doanh nghiệp không cần phải xin xác nhận của Bộ Y tế, phát sinh nhiều thủ tục hành chính.

Đồng thời, Cục Hải quan TPHCM kiến nghị sửa đổi Nghị định quy định theo hướng thực hiện theo Danh mục do Bộ Tài chính phối hợp với Bộ Y tế thống nhất ban hành.