Tại điểm a khoản 2 Điều 19 Luật Công nghệ cao quy định DN nông nghiệp ứng dụng công nghệ cao được hưởng mức ưu đãi cao nhất theo quy định của pháp luật về thuế GTGT, thuế XNK.

Khoản 11 Điều 16 Luật Thuế XK, thuế NK và Điều 14 Nghị định 134/2016/NĐ-CP quy định hàng hóa NK để tạo tài sản cố định của đối tượng được hưởng ưu đãi đầu tư theo quy định của pháp luật về đầu tư được miễn thuế NK (trong đó vật tư xây dựng được miễn thuế phải là loại trong nước chưa sản xuất được).

Cũng tại khoản 13 Điều 16 Luật Thuế XK, thuế NK và Điều 15 Nghị định 134/2016/NĐ-CP được sửa đổi, bổ sung tại khoản 8 Điều 1 Nghị định 18/2021/NĐ-CP quy định miễn thuế NK trong thời hạn 5 năm kể từ ngày bắt đầu sản xuất đối với nguyên liệu, vật tư, linh kiện trong nước chưa sản xuất được NK phục vụ sản xuất của dự án thuộc địa bàn có điều kiện kinh tế xã hội đặc biệt khó khăn hoặc thuộc danh mục ngành, nghề đặc biệt ưu đãi đầu tư; hết thời hạn 5 năm, người nộp thuế phải nộp đủ thuế theo quy định đối với lượng nguyên liệu, vật tư, linh kiện NK không sử dụng hết đã được miễn thuế.

Ngoài ra, tại Điều 30 Nghi định 134/2016/NĐ-CP quy định một trong các nguyên tắc xây dựng Danh mục miễn thuế là hàng hóa phải thuộc đối tượng được miễn thuế phải phù hợp với ngành nghề, lĩnh vực đầu tư, mục tiêu, quy mô, công suất của dự án, cơ sở sản xuất, hoạt động sử dụng hàng hóa miễn thuế.

Ảnh minh họa: H.Dịu

Bên cạnh đó, tại điểm 2 mục 2 phần a phụ lục 1 ban hành kèm theo Nghị định 118/2015/NĐ-CP (nay là Nghị định 31/2021/NĐ-CP) quy định nuôi trồng, chế biến, bảo quản nông lâm, thủy sản thuộc ngành, nghề đặc biệt ưu đãi đầu tư.

Cũng tại số thứ tự 54 phụ lục 2 ban hành kèm theo Nghị định 118/2015/NĐ-CP (nay là Nghị định 31/2021/NĐ-CP) quy định toàn bộ các huyện, các đảo, hải đảo thuộc tỉnh và thị xã Hà Tiên - tỉnh Kiên Giang thuộc địa bàn có điều kiện kinh tế - xã hội đặc biệt khó khăn.

Căn cứ xác nhận của Bộ NN&PTNT tại Quyết định số 5427/QĐ-BNN-KHCN ngày 28/12/2015 thì Công ty CP Trung Sơn là DN nông nghiệp ứng dụng công nghệ cao (Quyết định có hiệu lực 5 năm kể từ ngày cấp). Giấy chứng nhận đăng ký đầu tư số 2318777261 chứng nhận thay đổi lần thứ 6 ngày 15/12/2022 do Sở Kế hoạch và Đầu tư tỉnh Kiên Giang cấp cho dự án.

Theo đó, dự án đầu tư thuộc địa bàn có điều kiện kinh tế-xã hội đặc biệt khó khăn hoặc thuộc danh mục ngành, nghề đặc biệt ưu đãi đầu tư được miễn thuế NK đối với hàng hóa NK để tạo tài sản cố định cho dự án; miễn thuế NK đối với nguyên liệu, vật tư, linh kiện trong nước chưa sản xuất được NK phục vụ sản xuất trong thời hạn 5 năm kể từ ngày bắt đầu sản xuất theo quy định của pháp luật về thuế XNK.

Tổng cục Hải quan yêu cầu Cục Hải quan Kiên Giang căn cứ các quy định nêu trên, đối chiếu với hồ sơ thông báo Danh mục miễn thuế, Giấy chứng nhận đăng ký đầu tư và thực tế hàng hóa NK của án để áp dụng chính sách thuế, thủ tục thuế theo quy định.

Trường hợp áp dụng chính sách ưu đãi miễn thuế NK chưa đúng đối tượng thì thực hiện điều chỉnh đối tượng miễn thuế và xử lý theo quy định.